Information 지도 교수 : 김 주 한 교수 특성화 기간 : 2012.12.26 – 2013.2.25 실습 기관명 : 서울의대 정보의학실 시스템 바이오 정보의학 국가핵심연구센터 www.snubi.org 특성화 기간 : 2012.12.26 – 2013.2.25 이름.

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1 Information 지도 교수 : 김 주 한 교수 특성화 기간 : 2012.12.26 – 2013.2.25 실습 기관명 : 서울의대 정보의학실 시스템 바이오 정보의학 국가핵심연구센터 www.snubi.org 특성화 기간 : 2012.12.26 – 2013.2.25 이름 : 성 민 동 학번 : 2008133056

2 Objective

3 Expectation/Selection What I expected? What is Biomedical Informatics? Which tools and methods are used in this field? The future of the the field. Apply to medicine People who majoring in Biomedical informatics Why here? Interested in Computer Science before entering college of medicine. Medicine + Computer Science → Biomedical Informatics Go abroad? Domestic? There are two famous centers in biomedical informatics in Korea : SNUH, KAIST With Medicine… Finally, SNUH.

4 Experience - Workshop

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6 Experience – Seminar / J.club Seminar Every Mondays and Wednesdays The chance for each people’s research topic The most impressive things.. Adverse Drug Effects COPD RNA seq data Healthpro EMR system J.Club Every Saturdays interesting things in Biomedical Informatics fields NCRC seminar All members’ presentation All members’ own paper

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8 P value = 0.30 N = 124, events = 14 RED – HER2 amplification BLUE – HER2 del or normal TCGA – Gastric cancer and Her2 RA - microarray Gout - Medication Kawasaki – Echo data

9 Results What I learned… Tools for Data Analysis(Programming Languages) R(Statistic program) Python Programming Concepts of Translational Bioinformatics Cancer Genomics(TCGA, cBio) Personal Genomics(Pharmacogenomics, GWAS …) NGS Approach to open data Concepts of Medical Informatics EMR

10 Results Pros. 자율적이다. 한 사람이 한 주제를 다루고 사람들이 많아서 다양한 주제를 접할 수 있다. 연구실이 체계화 되어 있다. 서울대 인턴쉽 프로그램과 병행이 가능하다. Cons. 자기가 알아서 챙겨서 해야 한다. 사교성이 필요하다. 컴퓨터를 잘 해야 한다. Feedback Translational Bioinformatics 의 education material 이 PLOS ONE 에 출간되었다. 한 번 읽어보면 자세히 설명되어 있어 이 분야에 대해서 개념이 잡히게 된다. 그리고 자기가 한번 해 보고 싶은 것을 가져가서 해보면 도움이 많이 될 듯 하다. Conclusion 진짜 많은 것을 배울 수 있는 시간이었다. 연구 뿐만 아니라 연구실 시스템 등도 많이 배운 것 같아 나중에 의사가 되었을 때 피가 되고 살이 될 지식을 쌓은 시간 들이었다. 또한 이 분야에서 일하는 사람들을 많이 만나게 되어 나중에 collaboration 을 할 수 있을 것 같다.