질병관련 유전체 분석 기술 DNA Microarrays

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1 질병관련 유전체 분석 기술 DNA Microarrays
바이오융합기술프로젝트 서강대학교 화학과 박혜령

2 목 차 제1장 서론 제2장 Microarray의 개요 제3장 연구수행 내용 및 결과 제4장 연구목표 달성도
제5장 연구개발결과의 활용계획 제6장 결론 및 제언 제7장 참고문헌

3 제1장 서론: 연구 배경 및 목적 대단위 유전체 염기서열 결정의 속도를 향상시키고, 인간 유전체의 돌연변이를 효율적으로 검색하는 방법 개발하여 질병의 검색 및 분석에 이용 cDNA Sample을 이용하여 질병균의 발현을 확인하고 간접적으로 질병균의 존재를 검색 할 수 있다. 나아가 DNA detect를 통해 기회주의성 감염을 일으킬 수 있는 VBNC에 대한 직접적인 검색도 가능하다.

4 제2장: Microarray의 개요 DNA Microarrays란 염기서열을 알고 있는 DNA 분자를 소형 기판 위에 고밀도로 배열하여 대량의 유전자 발현 상황을 총체적으로 탐색할 수 있게 한 것이다. DNA chip 제작기술 DNA chip의 종류 Pin microarray cDNA/Oligonucleotide Photolithography Oligonucleotide Inkjet Electronic array

5 제3장 연구수행내용 및 결과 Overview 본 실험은 Sample과 DNA Chip을 각각 제작한 후, Hybridization과정을 거쳐 Software로 발광을 Scan하게 된다.

6 Reverse Transcription(RNA→cDNA)
제3장 연구수행내용 및 결과 Sample 제작 병원균으로부터의 RNA추출 Reverse Transcription(RNA→cDNA) Cy3,Cy5 Dye를 붙임 Purification drying

7 Purification/Gel illusion
제3장 연구수행내용 및 결과 Chip 제작 11가지 Primer를 통한 PCR Gel 전기영동 Purification/Gel illusion 정량 후, Chip에 찍기 drying

8 제3장 연구수행내용 및 결과 Sample & Chip 끓는물에서 Slide처리 42℃ ,Pre-Hybridization
Wash (SSC & SDS) Software을 이용하여 Scan

9 제4장 연구목표 달성도 Troubleshooting Positive Control Spot Damaged Substrate
Low Signal Intensity

10 제4장 연구목표 달성도 Cy3 & Cy5 Spot Doughnuts Comets

11 제5장 연구개발 결과의 활용계획 유전자 발굴, 암 분류, 유전자 발현 형태에 따른 질병 위험도 평가, 질병 예후 진단, 질병진단, 신약 개발, 독성학 연구, 식품 안정성 평가, 유전병 연구 등 cDNA 활용가능분야 Oligonucleotide활용분야 인체 유전자 기능분석 연구유전자 재조합 연구 실험용 동식물 모델 연구 질병관련 유전자 진단 유전자 치료 암관련 유전자 돌연변이 검색 약제내성 검색진단 DNA 염기서열 분석 유전자 변이 가계도 작성 장기 이식가능 조직 검사

12 제6장 결론 및 제언 유전체 수준의 연구 가능 One-gene in one experiment 탈피
대량의 유전자 발현 상황을 총체적 탐색 생물학적, 의약학적 연구의 핵심 기술 Microarray 자료에 대한 표준화된 품질 규격을 만들고 이들 자료에 대한 체계적인 데이터베이스를 통합하여 관리하는 노력 필요

13 제7장 참고문헌 A Molecular Cloning Manual: DNA Microarrays, CSHL Press, David & Joseph New Technique Development for Genome Analysis, 과학기술원, 강창원 Microarray, 한국과학기술정보원, 박태성