웹 기반 Alignment Program 졸업 프로젝트 - 중간발표 - 민혜라 신은정 장시경 황소영 컴퓨터 응용 공학 및 실습
Bioinformatics 열풍 Bioinformatic 이란 ? Genom project 로부터 유용한 생물학 데이터 저장 분석 및 해석 생물시스템의 정보처리 원리를 기초로 컴퓨터, 인공지능 시스템 개발 Bioinformatic 의 주력 분야 유전자 발현 분석 시스템 거대분자 구조 및 단백질 구조 분석 시스템 DNA/ RNA 염기 서열과 단백질 아미노산 서열분석 시스템
( 정렬 프로그램 1) 기존의 프로그램 예 유전자 탐침 설계를 위한 서열 정렬 프로그램
( 정렬 프로그램 2) 기존의 프로그램 예 염기서열 분석의 contig 구상 작업
우리가 만들고자 하는 것은 ? 공개 되어 있는 유전자 데이터 베이스를 이용해서 유전자를 정렬하고, 가능하다면 이를 입체적인 효과를 주어 보여주는 프로그램을 개발하 고자 한다. - 정렬한 DNA 상에서의 특정한 sequence 를 찾아내는 기능 -GC 의 분포가 특히 높은 부분을 찾는 기능 - 정렬 결과를 visual 하게 display
BIT 팀원 및 역할 분담 지도 교수님 인터페이스 BIT 데이타베이스 관리 알고리즘 및 코딩 서버 관리 황소영 민혜라 신은정 장시경 이상호 선생님
( 일정 및 계획 ) 3 월 -6 월 : 자료 조사 6 월 -7 월 : 정기적인 스터디 모임 (Phyton 언어, 유전자 알고리즘 ) 7 월 -8 월 : 설계 및 코딩 8 월 -9 월 : 테스팅 및 보완 9 월 -10 월 : 통합 및 종합 테스트
개발 툴 및 스터디 분야 개발 툴 NT Server, SQL Server, ASP, Python 스터디 분야 유전자 알고리즘, alignment algorithm, Python 언어
Ending... 생명 정보학에 관심이 있어서 이 주제를 잡게 되었다. 새로운 것을 개발한다는 것은 아무래도 무리일 것 같 지만, 기존에 나와 있는 프로그램과 DB 를 이용하여 우 리 손으로 직접 정렬 프로그램을 만들어 보고자 한다.