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III. 발효와 호흡 3.8 해당과정 3.9 발효의 다양성과 호흡 선택 3.10 호흡: 전자 운반체
3.11 호흡 : 양성자 동력(Proton Motive Force) 3.12 호흡: 구연산 회로와 글리옥실산 회로 3.13 이화(Catabolism)의 다양성
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3.8 해당과정 두개의 반응이 화학영양생물에서 에 너지 보존에 연결된다: 발효 (fermentation)와 호흡(respiration) (그 림 3.13) ATP 합성의 기작이 다름 발효: 기질수준 인산화(substrate level phosphorylation); ATP는 고 에너지 중간산물에서 직접 합성됨 호흡: 산화적 인산화(oxidative phosphorylation); ATP는 전자전 달에 의해 형성되는 양성자동 력)PMF)으로부터 생산됨
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3.8 해당과정 해당과정 (Embden–Meyerhof pathway): 포도당의 이화을 위한 보편적 경로 (그림 3.14)
혐기성 과정 세 단계
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3.8 해당과정 해당과정 포도당이 소모됨 두개의 ATP가 생산됨 발효 산물이 생성됨 일부는 인간의 소비를 위해 이용됨
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3.9 발효의 다양성과 호흡 선택 발효는 생성되는 산물에 따라 종류를 나눌 수 있음
Ethanol Lactic acid Propionic acid Mixed acids Butyric acid Butanol 발효는 발효되는 기질에 따라 종류를 나눌 수 있음 보통은 해당과정(포도당)이외의 경로를 지칭 아미노산 퓨린 (purines)과 피리미딘 (pyrimidines) 방향족 화합물
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3.9 발효의 다양성과 호흡 선택 Saccharomyces cerevisiae는 발효나 호흡을 수행할 수 있음
가장 이득이 되는 것을 수행함 호흡은 더 많은 ATP를 생성함 발효는 조건이 혐기성일 때 일어남
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3.10 호흡: 전자 전달체 호기성 호흡 (Aerobic respiration)
발효보다 더 높은 ATP 수율 전자전달에 의해 생성되는 양성자 동력을 소모하여 ATP가 생산됨 혐기성 호흡 (Anaerobic respiration) 산소 이외의 전자수용체 사용 예로서 nitrate (NO3–), ferric iron (Fe3+), sulfate (SO42–), carbonate (CO32–), 몇몇 유기 화합물이 있음
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3.10 호흡: 전자 전달체 전자전달계 (Electron transport systems) 막-연관 전자전달을 매개
전달 과정에 방출되는 에너지 일부를 보존하고 그것을 ATP 합성에 사 용함 많은 산화-환원 효소가 전자전달에 관여함 (예, NADH dehydrogenases, 플라보단백질, 철-황 단백질, 시토크롬)
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3.10 호흡: 전자 운반체 NADH dehydrogenases: 세포막의 안쪽 표면에 결 합하는 단백질; 활성 부위가 NADH에 결합하여 전 자 2개와 양성자 2개를 받아 플라보단백질에 전달 함 플라보단백질 (Flavoproteins): 플라빈 (flavin) 보결 분자단 (예, FMN, FAD)을 포함하며, 전자 2개와 양 성자 2개를 받지만 전달계의 다음 단백질에 전자만 전달함 (그림 3.16)
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3.10 호흡: 전자 운반체 시토크롬 (Cytochromes) 철-황 단백질 (Iron–sulfur proteins)
헴 (heme) 보결분자단을 포함하는 단백질 (그림 3.17) 헴의 철 원자를 통해 단일 전자를 주고 받음 철-황 단백질 (Iron–sulfur proteins) 철과 황의 클러스터(clusters)를 포함함 (그림 3.18) 예: 페레독신(ferredoxin) 환원전위는 철과 황 원자의 수와 위치에 따라 다 양함 전자를 운반함 Non-heme 철-황 단백질
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3.10 호흡: 전자 전달체 퀴논 (Quinones) 전자전달에 참여하는 소수성 비단백질-포함 분자 (그림 3.19)
전자와 양성자를 수용하지만 전자만 넘겨줌
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3.11 호흡: 양성자 동력 전자전달계는 세포막에서 전자가 양성자로부터 분리되는 방향 으로 배열되어 있음 (그림 3.20)
전자 운반체는 그 환원 전위의 순서대로 막에 배열되어 있음 전달계의 최종 운반체는 전자와 양성자를 최종 전자수용체에 전달함
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3.11 호흡: 양성자 동력 전자전달 과정 중에 여러 개의 양성자가 막 밖으로 방출됨
전자전달 과정 중에 여러 개의 양성자가 막 밖으로 방출됨 양성자는 NADH와 물의 해리로부터 유래됨 막을 통하여 pH와 전기화학적 준위의 구배를 생성 함 (양성자동력, proton motive force) 안쪽은 전기적으로 음성이며 알칼리성이 됨 바깥쪽은 전기적으로 양성이며 산성이 됨
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3.11 호흡: 양성자 동력 복합체 (Complex) I (NADH:quinone oxidoreductase)
NADH가 전자를 FAD에 줌 FADH 가 전자를 퀴논에 줌 복합체 (Complex) II (succinate dehydrogenase complex) 복합체 I을 우회함 FADH로부터 전자와 양성자를 직접 퀴논 풀 (pool)에 줌 복합체 (Complex) III (cytochrome bc1 complex) 전자를 퀴논으로부터 시토크롬 c에 전달함 시토크롬 c는 전자를 시토크롬 a와 a3로 전달함 복합체 (Complex) IV (cytochromes a and a3 ) 최종 한화효소 (Terminal oxidase); O2 를 H2O로 환원시킴
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3.11 호흡: 양성자 동력 ATP 합성효소 (synthase) (ATPase): 양성자동력을 ATP로 전환하는 복합 체; 두개의 구성성분 (그림 3.21) F1: 다중단백질 막 외 (extramembrane) 복합체; 세포 질과 접하고 있음 Fo: 양성자-수행 (proton- conducting) 막 내 (intramembrane) 채널 가역적; 양성자동력을 소모함 ** 절대발효성 세균(젖산균)은 호 흡을 할 수 없지만 ATPase를 가 지고 있다. 그 이유는? 발효과 정에서 생긴 ATP를 역반응시켜 PMF 얻음: 예, flagella 회전
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trisodium 2-hydroxypropane-1,2,3-tricarboxylate
3.12 호흡: 구연산 회로와 글리옥실산 회로 TCA cycle(tricarboxylic acid cycle,TCA), 구연산 회로 (Citric acid cycle) (CAC): 피루브산이 CO2로 완전히 산화되는 경로 (그림 3.22a) 초기 단계는 해당작용과 같음 (glucose에서 pyruvate로) 포도당 한 분자당 6 CO2 분자가 방출되며, NADH와 FADH 생성됨 이화작용과 생합성에 주요 역할을 함 호기성 호흡에 에너지적으로 이득이 됨 (그림 3.22b) Trisodium Citrate trisodium 2-hydroxypropane-1,2,3-tricarboxylate mp 150 C
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그림 3.22a The citric acid cycle.
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그림 3.22b The citric acid cycle.
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3.12 호흡: 구연산 회로와 글리옥실산 회로 구연산 회로는 생합성을 위한 많은 화합물을 생성 함
α-Ketoglutarate 와 oxaloacetate (OAA): 여러 아미노산 의 전구물질; OAA는 포도당의 phosphoenolpyruvate로 도 전환됨 Succinyl-CoA: 시토크롬, 엽록소, 기타 tetrapyrrole 화합 물의 합성에 요구됨 Acetyl-CoA: 지방산 생합성에 필요함
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3.12 호흡: 구연산 회로와 글리옥실산 회로 유기산은 많은 미생물들에 의해 전 자공여체 및 탄소원으로 대사될 수 있음
유기산은 많은 미생물들에 의해 전 자공여체 및 탄소원으로 대사될 수 있음 C4-C6 구연산 회로 중간대사산물 (예, citrate, malate, fumarate, succinate)은 보편적인 식물 천연 물 및 발효산물이며, 구연산 회로 만을 통하여 쉽게 이화될 수 있음 글리옥실산 회로 (Glyoxylate cycle) C2-C3 유기산의 이화작용은 보 통 글리옥실산 회로를 통하여 oxaloacetate의 생산을 포함함 (그림 3.23) 구연산 회로의 변이 글리옥실산이 주요 중간산물임
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3.13 이화의 다양성 미생물은 에너지 생산을 위한 다양한 기작을 보여줌 (그림 3.24) 발효 호기성 호흡 혐기성 호흡
화학무기영양 광영양
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3.13 이화의 다양성 혐기성 호흡 (Anaerobic respiration) 산소 이외의 전자수용체 사용
예로서 nitrate (NO3–), ferric iron (Fe3+), sulfate (SO42–), carbonate (CO32–), 몇몇 유기 화 합물이 있음 호기성 호흡에 비해 더 적은 에너지가 방출됨 전자전달, 양성자동력의 생성, ATPase 활성에 의존함 화학무기영양 (Chemolithotrophy) 무기화합물을 전자공여체로 사용함 Hydrogen sulfide (H2S), hydrogen gas (H2), ferrous iron (Fe2+), ammonia (NH3) 대개 호기성 무기 전자공여체의 산화로 시작됨 전자전달계와 양성자동력을 이용함 독립영양; CO2 를 탄소원으로 이용함 광영양 (Phototrophy): 빛을 에너지원으로 이용함 광인산화 (Photophosphorylation): 빛을 매개로 하는 ATP 합성 광독립영양생물 (Photoautotrophs): 생합성을 위한 CO2 동화에 ATP를 사용함 광종속영양생물 (Photoheterotrophs): 생합성을 위한 유기탄소의 동화에 ATP를 사용함
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