비특허문허 검색 Know-How 생명공학 분야 - 신 원 혜 생명공학심사과

생명공학분야 선행기술의 특성 급격히 발전하는 기술분야 → 기술범위가 방대 : 무수히 많은 종류의 생물체 및 질병 급격히 발전하는 기술분야 → 기술범위가 방대 : 무수히 많은 종류의 생물체 및 질병 → 신개념 기술용어 (jargons) 급증 → IPC 분류 세분화 미흡 (ECLA, F-term도 마찬가지) 선행기술의 >50% 비특허문헌이 차지 → C07K (54.5%), C12N (53.3%), C12Q (45.2%) 출원보다 발명자들이 논문ㆍ서열 DB 공개를 선행 → 각국의 공공연구기관이 DB 운영 → 사용 DB, 검색 브라우저 종류에 따라 검색 결과 상이 미국 > 유럽 > 일본 선행기술이 대다수를 차지 대다수의 선행기술이 영어로 기술

)) (( BT분야 선행기술검색의 관건 신개념 발명의 기술수준(state of the art) 및 동의·유사어 파악 통한 유효 키워드 선정 서치 대상 및 목적에 맞는 적절한 검색 데이터베이스 선택과 효과적 활용이 관건 3극 특허청 공동 Search Guidebook 발간 (2007.11.) (( ))

주요 선행기술 데이터베이스 특허문헌 DB 특실검색시스템, Delphion, Google PAT, STN 비특허문헌 DB 주요 선행기술 데이터베이스 특허문헌 DB 특실검색시스템, Delphion, Google PAT, STN PubMed (MedLine), KiSTi, Scholar Google, STN 비특허문헌 DB NGIC-KIPO, NCBI(GenBank), EMBL : 유전자ㆍ단백질 서열, 유전자 기능, 단백질 구조 STN : 서열 + 논문 + 특허 : SNP 같은 짧은 서열, 치환기 갖는 서열 검색에 유용 서열관련 DB

［ 서열, 유전자ㆍ단백질의 구성 유전자 (핵산) 서열 단백질 (아미노산) 서열 5’-ATGGCCTCATTCCAA-3’ 3’-TACCGGAGTAAGGTT-5’ 유전자 (핵산) 서열 N-Met-Ala-Ser-Phe-Gln-C 단백질 (아미노산) 서열 ［

BT분야 선행기술검색 SOP (1) 1 2 3 검색결과 특허청구범위 분석 – 서치 대상 선정 출원인/발명인의 선행기술 확인 발명의 서열 관련성 확인 및 검색 서열 발명 Blast STN 비서열 BT 발명 서열 관련 발명 비숙련분야? ECLA, MeSH 활용 배경기술리뷰,동의어 찾기 특허문헌 특실검색시스템 Google PAT Delphion 비특허문헌 PubMed Google KiSTi, STN 검색결과

BT분야 선행기술검색 SOP (2) 1 2 3 서열 관련 발명 검색결과 특허청구범위 분석 – 서치 대상 선정 출원인/발명인 선행기술 확인 - NDSL 2 3 발명의 서열 관련성 확인 및 검색 서열 발명 비서열 BT 발명 서열 관련 발명 비숙련분야? ECLA, MeSH 활용 배경기술리뷰동의어 찾기 특허문헌 특실검색시스템 Google PAT Delphion 비특허문헌 PubMed Google KiSTi, STN Blast STN 검색결과

NGIC-KIPO, GenBank, EMBL, Uniprot DB에서 BLAST BT분야 선행기술검색 SOP (3) 서열 활용 선행기술 검색 서열목록 STN 검색 치환기ㆍ변형기 포함 길이가 짧은 서열 Homology search가 불필요한 경우 Homology search NGIC-KIPO, GenBank, EMBL, Uniprot DB에서 BLAST blastp 단백질 서열 pshort 유전자 서열 blastn nshort

목 차 1 2 3 4 5 6 서지적 정보 활용한 검색 BLAST 서열 검색 STN 서열 검색 서열 + 키워드 검색 목 차 1 서지적 정보 활용한 검색 2 BLAST 서열 검색 3 STN 서열 검색 4 서열 + 키워드 검색 5 키워드 도출: 기술수준, 유사어·동의어 6 키워드 검색: PubMed, KiSTi, Google

1. 서지적 정보 활용한 검색  출원인이 산학협력단 ·학교 학술연구정보서비스 해당학교의 온라인 라이브러리 검색  출원인이 산학협력단 ·학교 해당학교의 온라인 라이브러리 검색 출원서의 최연소 발명인의 학위논문 출원서에 최초 기재된 발명인이 지도교수 논문에서는 교신저자가 지도교수 교신저자명으로 검색하면 동분야 기술수준 파악 학술연구정보서비스 학위 논문 등 한국교육학술정보원 제공 출원인·발명인 이름: 비특허문헌의 저자 http://www.riss4u.net/index.jsp

1. 서지적 정보 활용한 검색 서울대학교 도서관 http://thesis.or.kr/Search.jsp?uid=1&type=D

1. 서지적 정보 활용한 검색  

2. BLAST 서열 검색 장 점 단 점 NGIC-KIPO, NCBI, EMBL DB에서 BLAST는 서열 search algorithm 동일서열·유사서열 모두 검색 가능 sequence alignment 유관 PubMed 문헌이 Link되어 있어 편리 특허서열, 비특허서열 동시 검색 (DB 공유) 장 점 치환기·변형기 검색 X 키워드와 병행 검색 X 적정 길이 이상 이어야 유효 서치 가능 pShort/nShort 기능 이용하면 어느정도 극복 단 점

 2.1 BLAST 서열 검색 NGIC-KIPO NGIC-KIPO <제1항> 서열번호 2의 펩티드 <제1항> 서열번호 2의 펩티드  NGIC-KIPO 심사관 전용 DB: 미공개서열 보안 특허서열(pat)+비특허서열(nr)이 default 로 설정 요청시 심사관 의견 반영 가능

2.1 BLAST 서열 검색 NGIC-KIPO   

Sequence Revision History (최초 공지일 확인)  서열의 서지적 정보 확인 Sequence Revision History (최초 공지일 확인) http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/sutils/girevhist.cgi

   2.2 BLAST 서열 검색 NCBI NCBI BLAST family/doamin 정보를 한눈에 파악 - fusion 서열인 경우 발명의 구성 파악에 유용 default는 비특허서열(nr)로 기설정, 특허서열(pat) 검색시 별도 설정 필요 짧은 서열 검색용 nShort/pShort

 짧은 서열 검색 노하우 <제1항> “DAHK” 서열로 구성된 펩티드 일반 blast 또는 pShort 로는  짧은 서열 검색 노하우 <제1항> “DAHK” 서열로 구성된 펩티드 일반 blast 또는 pShort 로는 0건 검색 Positive search result

The Scientific & Technical Information Network 3. 서열목록 검색 – STN The Scientific & Technical Information Network 마쿠시 타입 치환기, 변형기 등을 포함한 동일서열 검색 서열+키워드 검색가능 짧은 서열 검색 가능 - 아미노산 `>4개 - 핵산 >10개 장 점 sequence homology search는 불가 유료 연산자, 검색필드, 등 옵션에 대한 숙련요구 단 점

3. 서열목록 검색 – STN

3. 서열목록 검색 – STN STN 검색식 <제1항> Blast 검색: 각 조합의 서열을 일일이 확인해야 하는 등 장시간의 노력 필요

3. 서열목록 검색 – STN STN 검색 결과 : 1~2분 내에 4개 참증 검색

4. “서열 + 키워드” 검색 문제점 해결방안 [제1항] 항체 및 초항원을 포함하는 단백질 [제2항] 제1항의 단백질은 서열번호 1의 단백질 주합/조합 서열에서 서열검색만 할 경우 대다수가 신규한 서열로 나타남 문제점 해결방안 서열 + 키워드 검색 ① 서열 BLAST 검색으로 단백질의 도메인 분석 ② 키워드 검색으로 유사한 주합/조합의 사례를 살핌 ③ 단순주합/조합(효과)인지 따져 용이 발명 판단

4. “서열 + 키워드” 검색 서열번호 1로 NCBI blastP 검색 “[항체-박테리아 초항원-항체]로 구성된 융합 단백질” 임을 단번에 확인 → 키워드 검색

MeSH (Medical Subject Heading) 5. 키워드 선정 - 길찾기 단시간내 기술수준ㆍ동의어 파악 전략 ECLA IPC보다 세분화된 EPO의 특허분류체계 - 실마리가 없을 때 배경기술 습득에 유용 http://l2.espacenet.com/eclasrch MeSH (Medical Subject Heading) PubMed* 문헌들의 indexing용 주제어들을 정리, 자동확장이 가능하여 BT분야 주제어의 상하개념 및 유사용어 확인이 가능 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez *PubMed는 미국국립의학도서관 산하 NCBI가 개발한 웹기반 검색시스템: 최신문헌정보로 업데이트 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

 5.1 배경기술수준 파악 ECLA <제1항> AAV-아데노바이러스 재조합 벡터 ECLA의 BT기술 커버력: 주요 특허는 유럽에 출원 생명공학분야 선행기술의 특성상, 비특허문헌이 >50% & EPO에 진입하지 않는 미국특허도 상당수이므로 기술수준 파악이나 보조적 검색수단으로 사용하는 것이 적절 <제1항> AAV-아데노바이러스 재조합 벡터 

5.1 배경기술수준 파악 ECLA IPC 분류  ECLA only

5.1 배경기술수준 파악 ECLA IPC 분류 4952건 검색 

5.1 배경기술수준 파악 ECLA ECLA only   174건 검색

기술수준(state of the art) 파악 5.1 배경기술수준 파악 ECLA [adeno associated virus]-[adenovirus]의 Chimaeric vector 15건 검색 이 문헌들 리뷰는 동분야의 기술수준(state of the art) 파악 또는 검색 실마리 찾기에 유용 c 

HIV penetrating peptide 유사ㆍ동의어는 ? 5.2 유사어ㆍ동의어 – MeSh HIV penetrating peptide 유사ㆍ동의어는 ?  다양한 종류의 penetrating peptide 정의 

5.2 유사어ㆍ동의어 – MeSh 기술용어의 정의·유사어 datasheet에 관리 유사어 추출 Penetrating peptide cell penetrating peptide CPP HIV TAT YGRKKRRQRRR Penetratin basic transduction peptide protein transduction domain PTD 기술용어의 정의·유사어 datasheet에 관리

5.2 유사어ㆍ동의어 – iHOP http://www.ihop-net.org/UniPub/iHOP/ 

6. 키워드 검색 HIV 세포 투과성 펩티드(penetrating peptide) 및 시토카인을 포함하는 펩티드 비 특 특 허 찾은 유사어들을 “or”로 연결 - <Fusion>, <cytokine> 을 “and” 로 추가 검색, - 유사어/하위개념으로 확장 HIV TAT peptide Penetrating peptide cell penetrating peptide CPP YGRKKRRQRRR Penetratin basic transduction peptide protein transduction domain PTD 특실검색 Delphion Google PAT 특 허 PubMed Google KiSTi 등 비 특 허

6.1 키워드 검색 – PubMed  PubMed 에서 키워드 검색   cytokine

6.1 키워드 검색 – PubMed  관련질병확인 ~ 용도발명  for full text

 6.2 키워드 검색 – 일반  비특허 문헌 검색 사이트 - KISTI : 국내논문 서치 검색툴  비특허 문헌 검색 사이트 - KISTI : 국내논문 서치 검색툴 http://www.yeskisti.net/yesKISTI/InfoSearch/DetailSearch.jsp - Google : 일반적인 외국 비특허문헌 서치 검색툴 www.google.com 

6.2 키워드 검색 – KiSTi 

6.2 키워드 검색 – Google  연산자 이용한 검색 “ ” 구문검색, + 근접연산자, - 제외연산자  연산자 이용한 검색 “ ” 구문검색, + 근접연산자, - 제외연산자  필드 명령어 이용한 검색 filetype, author, intitle, site, contents, link 별로 검색이 가능 filetype:pdf intitle:“wireless networking” author:“Braun” site:www.joinc.co.kr.co "socket api"

6.2 키워드 검색 – Google  연산자 및 필드명령어 활용한 검색 사례 

What’s Next? 적절한 DB선택 및 효율적 활용 Know-How로 하나의 선행기술도 놓치지 않기

감사합니다 shinweonh@kipo.go.kr 042-481-5591